贵州医科大学第二附属医院科研科以科研、继教为中心，主要负责医院的科研、进修管理、相关学术会议及培训、继续医学教育等相关工作。目前医院获得国家自然科学基金2项，贵州省科技厅项目26项，贵州省卫生健康卫项目48项，州级课题197项，承担GCP项目16项，至2015年以来发表论文共计1555余篇，其中SCI共44篇，影响因子共142，核心期刊共55篇，论著28本。科研项目数量、经费位居黔东南州三级甲等医院之首。

 具体职责如下：  
     一、在院长和分管领导的领导下，负责组织全院的科研、进修管理、继续医学教育的管理等工作。  
     二、组织申报科研项目及科研成果，组织科研项目的实施，并定期督促检查工作开展情况和经费使用情况。  
     三、负责院内科研相关奖项的申报、组织评审及管理工作。
     四、负责医院论文发表登记，组织评审优秀学术论文。做好科研技术档案的搜集、立卷、归档工作。  
     五、负责组织制定全院科研进修、继续医学教育计划，安排全院性业务活动、各类学习班及承办科研教学会议、学术讲座。  
     六、安排外出进修及来院进修管理工作，并督促检查贯彻执行情况。
     七、负责组织实施医院人才梯队培养和管理。  
     八、负责医院各科室及学术带头人培养对象的科教考核工作。
     九、配合教学科研工作，作好摄影、摄像、科研资料的收集和保存等工作。
     十、负责GCP项目、黔医人才计划及援黔专家工作。
     十一、负责新进人员岗前培训及全院医技人员三基考试工作。